祁连山作为中国的著名自然风景区之一，其美丽的景色可以在不同季节欣赏到不同的风貌。一般来说，祁连山的最佳旅游季节是在春秋两季，这个时间段的气候温和、阳光充足、风景秀丽，非常适合旅游和户外探险。
在春季，从4月到6月，祁连山的高山草甸、原始森林等地方会绽放出各种颜色鲜艳的野花，景色非常美丽，同时还有温泉可以享受。
在秋季，从9月到10月，祁连山的树叶变色时节，山间的枫叶、杨树等树种会变成黄、橙、红等色彩，形成一片片美丽的落叶林，远足、登山、露营等活动也非常适宜。
七、八月份
祁连山的四季不甚分明，春不象春，夏不象夏。所谓“祁连六月雪”，就是祁连山气候和自然景观的写照。———最佳旅游时间：七、八月份。
祁连山草原，它的代表大马营草原在焉支山和祁连山之间的盆地中。每年7、8月间，与草原相接的祁连山依旧银装素裹，而草原上却碧波万顷，马、牛、羊群点缀其中。
祁连山在秋季的九月份风景最好。
因为秋天是祁连山最美丽的季节，而九月份正是秋天的高峰期，此时山上的树叶由绿色逐渐变为红、黄、橙，景色极为壮观。
此外，九月份祁连山的天气也比较宜人，湿度较低，阳光充沛，非常适合旅行和观光。