有区别，区别在于，马自达6的原厂方向机与副厂方向机之间存在一些明显的区别。

首先，原厂方向机是由马自达汽车生产厂家生产并安装的，因此其质量和性能通常更加可靠和稳定。原厂方向机经过严格的生产和测试流程，与马自达6的整车设计和要求相匹配，因此能够更好地适应车辆的使用环境和条件。此外，原厂方向机通常享有较长的保修时间和质保服务，能够提供更好的售后保障。

相比之下，副厂方向机则是由第三方厂家生产的，其质量和性能可能存在差异。虽然副厂方向机在价格上可能更为便宜，但其质量和适应性可能不如原厂方向机。此外，副厂方向机的保修时间和质保服务通常也较短，可能无法提供与原厂方向机相同的售后保障。

综上所述，虽然副厂方向机在价格上可能具有优势，但对于追求质量和性能的车主来说，选择原厂方向机可能更为明智。