主要原因包括：
论文引用方面表现出色，论文篇均被引次数在中国内地高校中排名第一
在高影响力的科研、良好的国际合作和产业合作上都表现出色，科研成果得到了有效的转化
办学层次高，借鉴世界一流理工科大学的学科设置和办学模式，在本科、硕士、博士层次办学，成为引领社会发展的思想库和新知识、新技术的源泉
南方科技大学（南科大）是一所年轻的大学，成立于2011年。尽管其科研力量、校园氛围和学习条件都被认为是中上985水平，但其知名度相对较低的原因可能有以下几点：
1. 历史沉淀不足：与一些有着悠久历史的老牌高校相比，南科大的历史还很短，缺乏相应的品牌积累和传统。
2. 公众认知问题：由于高校等级次序已经相对固化，南科大在广东省内的认可度还算可以，但出了广东省的认可度就相对较低。
3. 资金优势：南科大的资金较为充足，可以为研究生提供相对合理的薪酬，这自然会吸引更多本科毕业生选择来南科大读研，从而提高其知名度。
4. 与C9的比较：虽然南科大在某些方面可能与C9相当或甚至更优，但由于历史和声誉的原因，一些人仍然更倾向于选择C9等知名学府。