1. 参保对象不同：居民医保主要面向未参加职工医保的居民，包括儿童、老年人、无业人员等。而灵活就业医保主要面向灵活就业人员，如自由职业者、个体户等。
2. 缴费标准不同：居民医保的缴费标准相对较低，每年在几百元到几千元不等。而灵活就业医保的缴费标准相对较高，一般每年在几千元到几万元不等。
3. 报销比例不同：居民医保的报销比例相对较低，一般在50%到70%之间。而灵活就业医保的报销比例相对较高，一般在70%到90%之间。
4. 保险待遇不同：居民医保的保险待遇相对较低，主要包括住院、门诊等医疗费用的报销。而灵活就业医保除了住院、门诊等医疗费用的报销外，还增加了生育保险、工伤保险等其他保险待遇。
5. 缴费期限不同：居民医保是按年缴费的，而灵活就业医保则是按月缴费的。
总体来说，南京居民医保和灵活就业医保在参保对象、缴费标准、报销比例、保险待遇和缴费期限等方面存在明显的差异。选择哪种医保取决于个人的具体情况和需求。
查询方法如下：
1、在辖区劳动保障局的系统完成实名认证和登陆。
2、在“办事”模块选择“就业困难人员认定”事项进行申报。
3、进入信息填报页面，输入身份证号码，点击“查询”自动关联身份信息。注意：提交申报材料时，可自动生成、拍照上传，也可复用历史材料。
4、填报上传材料完成后，进入签字程序，申请人签字确认后即可完成事项申报全流程。申请人可点击进入“我的办件”查询事项办理进度。
南京居民可以通过以下步骤使用医保卡进行缴费：1.南京居民可以使用医保卡进行医疗费用的缴费。
2.医保卡是南京居民参加城乡居民基本医疗保险的重要凭证，可以方便居民在就医时进行费用结算。
3.具体使用医保卡缴费的步骤如下： a.在就医前，持有效的医保卡和就诊相关证件前往医疗机构。
b.在医疗机构的收费窗口或自助缴费机上，将医保卡插入刷卡器或扫描二维码。
c.根据医疗机构的要求，输入个人密码或进行指纹验证等身份认证。
d.确认就诊信息和费用明细后，选择缴费方式，可以选择全额自费或使用医保卡支付部分费用。
e.完成缴费后，医保系统会自动结算并扣除相应费用，居民只需支付个人部分费用即可。
请注意，不同医疗机构可能有不同的操作流程，具体操作步骤以医疗机构的要求为准。
同时，南京居民还可以通过医保卡查询个人医保账户余额、报销记录等相关信息。