如果车主本人两年后想要在线申请免检，可以按照以下步骤进行：

打开交管12123，点击“备案非本人机动车”。

选择“扫码”或“短信验证备案”，进行非本人机动车的备案。

备案成功后，点击“免检车申领检验标志”按页面操作领取即可。

如果想要让他人代理申请年检合格标志，可以前往当地车管所办理。代理申请领取机动车年检标志时，需要准备车主身份证、代理人身份证、车辆交强险保单副本、车船税凭证、车辆行驶证原件等基本材料。然后，去车管所业务大厅领取机动车检验申请表，并如实填写后提交给工作人员审核。通过审核后，即可领取机动车免检合格标志。

请注意，上述步骤是基于最新的交管12123软件版本进行的描述。在实际操作过程中，如果遇到任何问题，建议咨询当地交通管理部门或相关机构以获取最准确的信息和指导。