支原体的结构比较简单，多数呈球形，没有细胞壁，只有三层结构的细胞膜，故具有较大的可变性。
支原体的大小为0.1～0.3um，可通过滤菌器，常给细胞培养工作带来污染的麻烦。菌落小(直径0.1~1.0mm)，在固体培养基表面呈特有的“油煎蛋”状。无细胞壁，不能维持固定的形态而呈现多形性，对渗透压敏感，对抑制细胞壁合成的抗生素不敏感。
支原体是一种原核生物，其细胞内确实含有核糖体。核糖体是细胞内一种重要的细胞器，它参与蛋白质的合成和转录后修饰过程。支原体虽然体积较小，但它们仍然需要合成蛋白质来维持其生命活动，因此它们拥有核糖体这种基本的细胞器。
支原体遗传物质是DNA。
因为遗传物质的载体一般是染色体和线粒体以及叶绿体等，染色体的主要遗传信息载体，由DNA组蛋白非蛋白及RNA等物质组成，属于一种核蛋白复合物，身体内的支原体具有细胞结构，细胞内生物的遗传物质都是DNA。