巨蜥3-5年性成熟 ，每年七月发情，在5-8月期间交配，雄性巨蜥通过打斗来确定交配者，时常有伤亡发生。

胜利的雄性巨蜥会用下巴摩擦雌性的头，刮她的背，若雌性巨蜥对雄性满意，则会反过来摩擦雄性。一般来讲，交配后，雄性会继续留下几天，阻止其他雄性交配。巨蜥约于9月产卵。刚成熟的雌蜥只能产4-6枚卵，每隔2-3天产一次，一窝卵平均有20颗卵，孵卵期为7个月，雌性会将卵产在地底或树穴，保护它们。

十岁左右，进入产卵旺期，每次产下二十几枚，将卵埋在沙窝里，靠太阳辐射 的自然温度孵卵，八个月后，幼蜥才破壳而出。刚出壳时，小蜥大小如同我们饲养的家鹅 。它能活50年左右。