(一)平等原则

平等原则一方面是指农民群体和社会其他成员之间的平等，另一方面是指农民群体内部的平等，它是说，不能以突出保护某些农民群体的利益而损害其他农民的利益，不能以牺牲少数农民利益为代价来保护多数农民的利益。

(二)合法原则

立法所要保护的权利应该建立在宪法、法律和行政法规所赋予的权利的基础上，《农民权益保护法》是保护农民依法享有权利的立法，而不完全是为农民设定新权利的立法，在性质上不是一部赋权的法律。[6]从这个意义上说，农民权益保护立法是保障护农民权益实现的立法。所以说，这部法律的目的和功能在于保护农民已有和应有法定权利的实现。

(三)便民原则

在农民寻求权利保护的过程中，应当保护其行为的有效和便捷，这应当是《农民权益保护法》的一个方向。具体例如，在举证责任的分配上，应当针对权益的性质和农民维权的难度来确定;在对农民维权请求的审查期限上应体现出及时性，因为现实中对于农民权益保护请求的拖延，实际上也是侵害农民权益的一种形式;在农民权益案件的受理上，行政受理和司法受理必须要考虑到农民的特点，应当求相关的机关承担相应提示和说明义务。

(四)节约原则

对于与农民权益相关的纠纷，因其处理方式不同会产生不同的经济成本，所以立法在制度设计上应当考虑农民的承受能力，建立相应的制度，减少农民在维权过程中的时间、精力和费用的支出。

农民工权益生态问题

众所周知，农民之所以纷纷外出务工，其主要原因在于农业收入的相对低下和土地的缺乏，促使农民日益倾向于非农职业，自愿放弃农业、外出务工以挣得高于农业的收入。同时，伴随着改革开放的推进，创造了大量非农就业机会，带动了一批又一批的农民进城务工。