巨骨舌鱼4到5年达到性成熟，亲鱼自然配对，在生殖季节到来时会在浅滩上挖穴产卵，一般的在沙质底上挖一个大约15厘米深、50厘米宽的穴巢，将鱼卵产于其中，每次产卵大约16万粒，分数次产下，三到五天小鱼苗即可孵化而出。
巨骨舌鱼是胎生的鱼类，母鱼在体内孕育幼鱼，通过胎盘与卵黄囊的联合滋养进行营养交换。
受精后，卵子会在卵黄囊中发育成鱼仔，而胎盘则提供氧气和营养物质，从而支持幼鱼的生长和发育。巨骨舌鱼的受孕过程与哺乳动物相似，都需要母鱼在体内孕育幼鱼，但与哺乳动物不同的是，巨骨舌鱼并不具备胎盘的完整结构，而是通过卵黄囊和胎盘联合滋养的方式进行幼鱼的营养交换，这也是其独特的生殖方式之一。
巨骨舌鱼是一种大型的骨舌鱼，在配对养殖时，应提供较大的鱼缸，并在缸中布置枯枝、沉木等，打造一个类似原生态的繁殖环境。
雄鱼的体形较瘦长而流线，雌鱼的体型较粗圆。繁殖期间，最好提供适宜的饲料，以动物性饲料为主，促进亲鱼的发情和钙的吸收。同时，繁殖缸要尽量做到宽敞，以方便以后换水操作。
繁殖季节，雌鱼产卵前需经过人工刺激，可增加产卵量。产卵前需准备繁殖箱，将亲鱼放入其中。亲鱼会自行配对，并筑巢产卵。受精卵约2天后会孵化，此时要保持水质清洁，约4-5天就可喂食。
至于配对的方法，可以观察亲鱼的互动来判断。如果雄鱼和雌鱼相处融洽，没有攻击性，那么就可以认为它们已经成功配对。在配对成功后，应避免打扰亲鱼，以免亲鱼受到惊吓而停止产卵或迁移。
具体的操作方法和注意事项应咨询专业人士。