不可以代签。
因为根据《中华人民共和国治安管理处罚法》第63条第1款规定，有关的证件、证明文件应当由本人持有或者使用，不得转借、转让、伪造或者变造。
因此，澳门通行证需要本人亲自前往签发机关进行办理，不允许他人代签。
可以前往户口所在地的公安局出入境管理部门办理(即第一次办理《港澳通行证》的地方)。可以在自助办证大厅的自助机上进行续签。可以在“支付宝”的城市服务里找到办事大厅,在政务里有关于出入境港澳台签证。
港澳通行证签注可以异地办理。异地办理需要提供本人有效的身份证明，就业人员需提供一年及以上有效的居住证、社保证明，高等院校在读的学生需提供加盖学校公章的证明及学生证，就可以异地办理签注。